En 1876, l'École de Médecine (appelée Ancienne École de Médecine dès 1980) est créée.

"Il est créé dans l'Académie de Genève, qui prend le nom d'Université, une faculté de médecine" (Charles Borgeaud, Histoire de l'Université).

Étudiant-es en médecine devant l’École de médecine en 1893

Une loi coutumière admise au XIX^e siècle mentionnait qu'une Université devait comprendre quatre facultés, dont la médecine. En 1848 déjà les disciplines médicales sont enseignées à l'Académie.

En 1873, la loi portant sur la création de la faculté de médecine est adoptée.

Le bâtiment, conçu pour loger la faculté de médecine afin d'y enseigner l'anatomie, l'histologie, la physiologie et l'hygiène est construit par les architectes Reverdin, Gouy et Gampert de 1874 à 1876 et inauguré en 1876.

Doyen de la faculté, le professeur Juillard, souligne lors de l'inauguration de l'École que les locaux et les installations sont comparables à ceux des meilleures universités d'Europe. Il mentionne également que "cette faculté de médecine aura un caractère international que nulle autre ne possède en Europe".

En 1994, débutent la transformation et la rénovation du bâtiment. Le bâtiment est actuellement utilisé par la section de physique.