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La Bibliothèque CMU vous propose un service d’aide à la recherche documentaire biomédicale.
Notre service vous aide sous forme de conseil et d'accompagnement concernant la méthodologie de recherche documentaire.
Ce service est gratuit et ouvert exclusivement:
- Aux collaborateurs et collaboratrices UNIGE/HUG: étudiants, étudiantes, chercheurs, chercheuses et médecins en médecine humaine et dentaire ou sciences pharmaceutiques, pour autant qu’ils ou elles réalisent des travaux liés à l’UNIGE ou HUG.
Si vous êtes externe, professionnel-les de la santé ou collégien ou collégiennes veuillez, svp, vous adresser personnellement à la réception de notre bibliothèque ou envoyer un message à biblio-cmu-ref(at)unige.ch.
Si vous êtes un patient, patientes, veuillez vous référer à l’onglet Patient-es.
Controle242PileTest
Revue de littérature
Vous êtes en train de préparer un(e):
- Article original
- Protocole d'études (bibliographie)
- Préparation d’un colloque/exposé
- Travail de mémoire de Master
- Thèse de Doctorat
- Rapport d’étude/stage
- Construire une bibliographie sur une question
Et vous avez besoin d’établir une liste de références d’articles, ouvrages ou portails de recherche en relation avec votre sujet.
Nous pouvons vous conseiller dans la réalisation de vos recherches pour obtenir une liste de références pertinentes. Nous vous accompagnons pour les étapes suivantes:
- Utilisation des ressources de la bibliothèque CMU
- Identification des sources appropriées : bases de données, autres catalogues, portails etc.
- Méthodologie de recherche pour l’utilisation optimale des outils (terminologie, opérateurs, stratégie de recherche, etc.)
Il existe différents types de revue de littérature. Il est très important de bien identifier le type de recherche de littérature avant de commencer son projet. Deux exemples :
Synthèse de la littérature : étude qui décrit et résume l'état de la connaissance sur un sujet et les résultats de plusieurs recherches sur ce sujet. L'analyse peut être chronologique, conceptuelle, thématique, etc.
Revue narrative : permet d'avoir une vue générale sur un sujet précis, pour soulever des problèmes habituellement négligés et encourager d'autres recherches sur ce sujet. Les critères méthodologiques sont moins élevés dans une revue narrative que dans une revue systématique. Source: Université de Montréal. Rédiger une revue systématique: Distinguer les revues de littérature.
Autres sources pour l’identification du type de revue de littérature:
- Grant MJ, Booth A. A typology of reviews: an analysis of 14 review types and associated methodologies. Health Info Libr J. 2009 Jun;26(2):91-108. PMID: 19490148
- Anthea Sutton, Mark Clowes , Louise Preston, Andrew Booth. Meeting the Review Family: Exploring Review Types and Associated Information Retrieval Requirements. Health Info Libr J. 2019 Sep;36(3):202-222.doi: 10.1111/hir.12276. PMID: 31541534
- LibGuide. Université Laval. Comparaison des types de revues de littérature : revues narratives et revues systématiques.
- CQUniversity Library. What is a litterature review ?
- Cochrane Training. Scoping reviews: what they are and how you can do them
- Cochrane Training.Introduction to rapid reviews
Il est important de bien structurer sa recherche de documentaire. Les vidéos suivantes expliquent quelques étapes clés d’une recherche (cliquer sur "Plan de recherche documentaire") : https://infotrack.unige.ch/
Méthodologie
- Recherche structurée de littérature. Guide méthodologique. Bibliothèque universitaire de médecine de l'Université de Lausanne et du Centre hospitalier universitaire vaudois [En ligne]. Recherche structurée de littérature [cité le 12 octobre 2022].
- Méthodologie de recherche dans les bases de données. HES Haute Ecole de Santé Valais. Médiathèque santé Sion. Février 2021, Pauline Melly.
Outils de recherche (listes non exhaustives)
Bases de données:
Outil d'aide à la décision clinique:
Liste complète des bases de données accessibles via l’UNIGE
VPN pour membres HUG (accès à distance aux ressources UNIGE)
Autres outils:
Obtention Textes intégraux (via réseau UNIGE):
- Dans les bases de données (PubMed, Embase), depuis la page de référence du document souhaité : bouton « Obtenir »
- Swisscovery : citation linker (liens aux ressources électroniques UNIGE)
- VPN pour membres HUG (accès à distance)
- VPN pour membres UNIGE (accès à distance)
- Demander des numérisations et des documents hors UNIGE (service gratuit pour les membres de la communauté Unige – HUG)
Ressources:
- Nouveau PubMed. Nouvelles fonctionnalités et améliorations. UNIL Université de Lausanne. Bibliothèque universitaire de médecine. Version 15/05/ 2020
- PubMed User Guide
- PubMed Online Training
- Embase Quick User Guide
- Recherche dans Google Scholar. UNIL Université de Lausanne. Bibliothèque universitaire de médecine. Version septembre 2020
- HeTOP Portail Terminologique de Santé
- SYNTAXE BASES DE DONNÉES Bibliothèque universitaire de médecine - FBM|CHUV Lausanne 2020
- Astuces et syntaxes. Bases de Données en sciences de la Santé. Bibliothèque Université Laval - octobre 2021
Outils gestion de références bibliographiques
- EndNote
- Installation EndNote étudiants/collaborateurs UNIGE
- EndNote X9. Guide d'utilisation. UNIL Université de Lausanne. Décembre2019.
- EndNote 20. Guide d'utilisation. Bibliothèque universitaire de médecine de l'Université de Lausanne et du Centre hospitalier universitaire vaudois [En ligne]. EndNote 20 [cité le 12 octobre 2022]
- Zotero
- Zotero quick start guide
Formations Bibliothèque UNIGE
Quelques ressources pour vous guider dans l’écriture d’une revue de littérature
Ouvrages :
-
Les essentiels de la recherche bibliographique en santé : chercher, organiser, publier. Evelyne Mouillet. Paris : Doin. 2016
-
Conducting research literature reviews : from the internet to paper. Fink, Arlene ; 5th ed.os Angeles : SAGE; 2020.
-
The literature review : a step-by-step guide for students; Ridley, Diana. Los Angeles : Sage 2nd edition - 2012
Autres :
- Equator network. Reporting guidelines for main study types.
- Comment rédiger un article scientifique de type revue narrative de la littérature ? Chiara Saracci, Maryam Mahamat, Frédérique Jacquérioz.Rev Med Suisse 2019; volume 15. 1694-1698
- Ten Simple Rules for Writing a Literature Review. Pautasso M. 2013. PLoS Comput Biol 9(7): e1003149. Doi : 10.1371/journal.pcbi.1003149
- Cochrane Training.Introduction to rapid reviews
- Karolinska Institutet. University Library. Structured literature reviews – A guide for students
- McMaster University. Centre de collaboration nationale des méthodes et outils. Rapid Review Guidebook
- The Literature Review: A Few Tips On Conducting It Dena Taylor, Health Sciences Writing Centre
- Bibliothèque CMU UNIGE. Publier-Diffuser. Rédiger
Nous vous proposons de remplir le Formulaire de soutien pour une recherche de littérature. Envoyer à biblio-cmu-ref(at)unige.ch
Dès la réception du formulaire rempli, nous pourrons vous fournir les informations nécessaires ou vous proposer un rendez-vous dès que possible.
Les demandes d’aide à la recherche sont traitées par ordre d’arrivée et selon nos disponibilités. Une seule question par usager et un maximum de 20h de soutien par question.
Revue Systématique
Une revue systématique est un type de publication, suivant des règles explicites de méthodologie de recherche de littérature, pour répondre à une question précise. C’est une synthèse rigoureuse et reproductible des résultats d'études originales existantes, en réponse à une question précise de recherche. Elle peut être qualitative si elle fournit une synthèse d’études de recherche, ou quantitative « méta-analyse » si elle contient le traitement statistique pour synthétiser les résultats des études.
Source : Higgins JPT, Thomas J, Chandler J, Cumpston M, Li T, Page MJ, Welch VA (editors). Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions. 2019. online Cochrane Handbook for Systematic Reviews
Article: Martinic MK, Pieper D, Glatt A, Puljak L. (2019). Definition of a systematic review used in overviews of systematic reviews, meta-epidemiological studies and textbooks. BMC Medical Research Methodology
doi: https://doi.org/10.1186/s12874-019-0855-0
Principales caractéristiques d'une revue systématique :
- Objectifs clairement définis avec des critères d'admissibilité prédéfinis pour les études (inclusion/exclusion)
- Méthodologie explicite pouvant être reproduite
- Recherche systématique qui tente d'identifier toutes les études qui correspondent aux critères d'admissibilité (exhaustivité)
- Evaluation de la validité des conclusions des études incluses, par exemple en évaluant le risque de biais
- Présentation systématique et synthèse des caractéristiques et des résultats des études incluses
Source : https://uottawa.libguides.com/revuessystematiques
Les revues systématiques ont le plus haut niveau de preuve dans la classification de différente types d’études:
Source : EBM Pyramid and EBM Page Generator, copyright 2006 Trustees of Dartmouth College and Yale University. All Rights Reserved. Produced by Jan Glover, David Izzo, Karen Odato and Lei Wang.
L’utilisation du terme revue systématique peut prêter confusion avec d’autres types de revue. Il est donc essentiel de s'assurer que son projet de recherche correspond bien à une revue systématique.
Les revues narratives ou les revues de littérature sont des exemples de types de revue plus connus. Ces deux types de revues sont recommandées pour présenter un aperçu général d'un sujet, faire l’introduction dans un article ou en support de preuves sur un cas présenté.
Source : Assembling the Pieces of a Systematic Review: A Guide for Librarians, édité par Margaret J. Foster et Sarah T. Jewell, Rowman & Littlefield Publishers, 2017
Différences et similarités entre une revue systématique et un autre type de revue ayant une approche systématique :
Source : https://uottawa.libguides.com/ld.php?content_id=34150355
Autre sources :
- LibGuide University of Newcastle. Systematic Reviews: What is a systematic review?
- Cochrane Library vidéo « What are Systématic reviews »
- Knowledge Translation Program. What Review is Right for You ?
Articles sur les différents types de revue de littérature:
- Grant MJ, Booth A. A typology of reviews: an analysis of 14 review types and associated methodologies. Health Info Libr J. 2009 Jun;26(2):91-108. PMID: 19490148
- Anthea Sutton, Mark Clowes , Louise Preston, Andrew Booth. Meeting the Review Family: Exploring Review Types and Associated Information Retrieval Requirements. Health Info Libr J. 2019 Sep;36(3):202-222.doi: 10.1111/hir.12276. PMID: 31541534
- Pippa Hemingway, School of Health and Related Research(ScHARR),University of Sheffield.Bandolier.org. What is...? Series. Evidence-based medicine. What is asystematicreview?
Notre service vous propose un soutien dans le processus de réalisation d’une revue systématique sous forme de conseil et d’accompagnement. Une seule question sera traitée par usager (communauté Unige, HUG médecins), avec une limite maximum de 20h de soutien, par ordre d’arrivée et selon nos disponibilités.
Nous pourrons vous aider dans:
- la formulation de votre question de recherche
- la recherche de revues systématiques déjà existantes sur le sujet
- le choix des bases de données à consulter
- l'élaboration des stratégies de recherche dans les bases de données (peer review the search strategy)
Cependant nos spécialistes ne vous accompagnent pas dans:
- la rédaction de votre protocole
- l'analyse et le choix des articles
- l'export vers un logiciel de gestion bibliographique
- la création de votre base de données bibliographique
- l'extraction et l'analyse des données
Une revue systématique analyse les faits scientifiquement établis sur un sujet précis en suivant une méthodologie rigoureuse avec une méta-analyse des résultats ou non. C’est le fondement de la médecine basée sur les preuves (evidence-based medicine) et le développement des recommandations cliniques.
Quelques buts de la réalisation d’une Revue Systématique :
- Analyser et critiquer les affirmations contradictoires dans les publications
- Soulever les problèmes de fiabilité en information médicale
- Synthétiser un volume important d'informations sur un sujet donné
- Analyser l’efficacité ou les risques d’un traitement ou d’un test de diagnostic pour éclairer la prise de décision et établir des nouvelles normes et bonnes pratiques.
« Les revues systématiques auront une importance fondamentale pour l'avancée des connaissances, puisqu'elles permettent d'identifier certaines lacunes et de développer de nouveaux domaines de recherche. »
Sources :
Young, S. et Eldermire, E. (2017). The Big Picture : Finding, Evaluating, Applying Systematics Reviews Accross Disciplines. Dans M.J. Foster et S.T. Jewell, Assembling the Pieces of a Systematic Review. Lanham, Maryland : Rowman & Littlefield Publishers.
Cochrane handbook for Systematic Reviews- Chapter 1 : Starting a review
Lasserson TJ, Thomas J, Higgins JPT. Chapter 1: Starting a review. In: Higgins JPT, Thomas J, Chandler J, Cumpston M, Li T, Page MJ, Welch VA (editors). Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions version 6.0 (updated July 2019). Cochrane, 2019. Available from www.training.cochrane.org/handbook.
La réalisation d’une revue systématique doit suivre des étapes bien précises. Chaque étape est importante afin de produire une synthèse rigoureuse de la documentation.
Etapes de la réalisation d’une Revue Systématique :
Source : Wikipedia. Centre for Health Communication and Participation La Trobe University, Australasian Cochrane Centre. Ce diagramme illustre ce que font les auteurs d'une revue systématique.
Article:
Muka T, Glisic M, Milic J, Verhoog S, Bohlius J, Bramer W, Chowdhury R, Franco OH. A 24-step guide on how to design, conduct, and successfully publish a systematic review and meta-analysis in medical research. Eur J Epidemiol. 2020 Jan;35(1):49-60. doi: 10.1007/s10654-019-00576-5. PMID: 3172091
Il existe plusieurs façons de formuler les questions selon le sujet, la discipline ou le type de question. Le modèle le plus courant pour les sujets liés à la santé est le PICO, qui représente la population (patient, maladie), l'intervention, la comparaison et les résultats. Le modèle PICO est indiqué pour formuler des questions cliniques spécifiques. Plusieurs modèles sont répertoriés dans le tableau ci-dessous. Ces modèles permettent à l’auteur d'énoncer clairement et spécifiquement la question. La question est la base du projet de recherche, il est donc essentiel de prendre le temps de bien la construire.
La recherche préalable de revues systématiques déjà publiées permet de vérifier qu'une revue sur la même question n'a pas été publiée récemment ou qu’un protocole d’une revue identique en cours a été enregistré.
Si une revue sur le même sujet a déjà été réalisée depuis un certain temps, il serait pertinent de réaliser une nouvelle revue si des informations supplémentaires sur le sujet ont été publiées depuis.
Où chercher une Revue Systématique et/ou enregistrer un protocole de revue systématique? (liste non-exhaustive)
- Cochrane Library (revues et protocoles Cochrane)
- Prospero : International prospective register of systematic reviews
- Epistemonikos database
- Embase
Filtres : ([cochrane review]/lim OR [systematic review]/lim OR [meta analysis]/lim) - PubMed
Filtres : Meta-Analysis, Systematic Review - OSF Registries
- BMJ Open (revue scientifique)
- Systematic Reviews (revue scientifique)
- BioMed Central Protocols (revue scientifique)
- Preclinical Systematic Review & Meta-analysis Facility (SyRF)
- Research Registry
- Campbell Collaboration : Business & Management, Crime & Justice, Disability, Education, International Development (including Nutrition), Knowledge Translation & Implementation, Social Welfare
- Zenodo
Outils d’évaluation pour vérifier la qualité d’une revue Systématique :
McMaster Critical Review Form
Il existe plusieurs façons de formuler les questions selon le sujet, la discipline ou le type de question. Le modèle le plus courant pour les sujets liés à la santé est le PICO, qui représente la population (patient, maladie), l'intervention, la comparaison et les résultats. Le modèle PICO est indiqué pour formuler des questions cliniques spécifiques.
Plusieurs modèles sont répertoriés dans le tableau ci-dessous. Ces modèles permettent à l’auteur d'énoncer clairement et spécifiquement la question. La question est la base du projet de recherche, il est donc essentiel de prendre le temps de bien la construire.
Source : Assembling the Pieces of a Systematic Review: A Guide for Librarians, édité par Margaret J. Foster et Sarah T. Jewell, Rowman & Littlefield Publishers, 2017. (tableau adapté)
L’outil ou modèle PICO permet d'identifier les 4 composantes d'une question clinique:
- P: Chez les patients (population, maladie) avec...
- I: Est-ce que cette intervention (ou exposition)...
- C: Comparativement à...
- O: Donne des résultats pour la santé du patient ? Qu'est-ce qui est mesuré ↑↓ ? (Outcome)
Source :Université de Montréal - LibGuide. Poser une question clinique. Types de question.Formulaire PICO
Autres modèles :
- PIE ( Patient/Population/Problem, Intervention, Evaluation/Effect) : qualitative research questions
- PEO (Population and their problems, Exposure, Outcomes or themes) : qualitative research questions
- SPICE (Setting, Population, Intervention, Comparator, Evaluation) : qualitative research questions, Healthcare researech and Social science
- SPIDER (Sample, Phenomenon of Interest, Design, Evaluation, Research type): mixed-methods research
- FINER (Feasibility, Interesting, Novel, Ethical, Relevant): qualitative or quantitative
Articles :
- PICO, PICOS and SPIDER: a comparison study of specificity and sensitivity in three search tools for qualitative systematic reviews
- Beyond PICO: the SPIDER tool for qualitative evidence synthesis
Ressources :
- LibGuide McGill."You have an idea for a review topic !"
- CEBM Oxford University. Asking Focused Questions
- Unisanté Lausanne. Question de recherche
- Doing a Systematic Review: A Student's Guide. Second Edition by Angela Boland. Chapter 3: Defining My Review Question
- Cornell University.A Guide to Evidence Synthesis. Developing Your Research Question
- BMC Med Inform Decis Mak. 2007; 7: 16.doi: 10.1186/1472-6947-7-16.PMID: 17573961 . Connie Schardt. Utilization of the PICO framework to improve searching PubMed for clinical questions
La recherche préalable de revues systématiques déjà publiées permet de vérifier qu'une revue sur la même question n'a pas été publiée récemment ou qu’un protocole d’une revue identique en cours a été enregistré.
Si une revue sur le même sujet a déjà été réalisée depuis un certain temps, il serait pertinent de réaliser une nouvelle revue si des informations supplémentaires sur le sujet ont été publiées depuis.
Où chercher une Revue Systématique et/ou enregistrer un protocole de revue systématique? (liste non-exhaustive)
- Cochrane Library (revues et protocoles Cochrane)
- Prospero : International prospective register of systematic reviews
- Epistemonikos database
- Embase
Filtres : ([cochrane review]/lim OR [systematic review]/lim OR [meta analysis]/lim) - PubMed
Filtres : Meta-Analysis, Systematic Review -
Campbell Collaboration : Business & Management, Crime & Justice, Disability, Education, International Development (including Nutrition), Knowledge Translation & Implementation, Social Welfare
Outils d’évaluation pour vérifier la qualité d’une Revue Systématique et autres publications:
Il est conseillé de rédiger un protocole et de l’enregistrer dans un registre avant le début de la réalisation d’une Revue Systématique. Le registre préalable d'un protocole permet d’éviter des doublons de revues semblables.
La rédaction d’un protocole met en évidence toutes les étapes de la revue systématique. Un protocole de revue systématique décrit la question de recherche, les objectifs de la revue, la méthodologie et la stratégie de recherche.
Buts d’un enregistrement de protocole de revue :
- Informer les chercheurs dans leurs domaines
- Empêcher la duplication inutile de recherches
- Réduire l'impact des biais des auteurs de la revue
- Informer la méthodologie utilisée
Contenu d'un protocole
- Question claire
- Objectifs de la revue
- Critères d'inclusion et exclusion
- Stratégie de recherche
- Méthodologie explicite
Critères d'inclusion et exclusion
Permettent de définir les caractéristiques d'études à inclure / exclure dans la revue systématique: PICO, Study design, langue, années de publication, etc.
Guidelines pour écrire un protocole :
- University of York. National Institute for Health Research. Guidance notes for registering a systematic review protocol with PROSPERO
- Cochrane Interactive Learning
- PRISMA for systematic review protocols (PRISMA-P)
- PRISMA: What is a protocol ?
- PRISMA-P (Preferred Reporting Items for Systematic review and Meta-Analysis Protocols) 2015 checklist: recommended items to address in a systematic review protocol
- BMJ Author Hub
Où enregistrer un protocole ? Liste de Registres de Protocoles (non exhaustive) :
- Cochrane Library (pour protocoles revues Cochrane)
- Prospero : International prospective register of systematic reviews
- OSF Registries
- SRDR Systematic Review Data Repository
- Research Registry
- Joana Briggs Institute SR Register
- Campbell Collaboration :Business & Management, Crime & Justice, Disability, Education, International Development (including Nutrition), Knowledge Translation & Implementation, Social Welfare
Pour la réalisation d’une revue systématique il est fortement recommandé que la recherche soit réalisée sur multiples bases de données appropriées.
Buts de la recherche sur plusieurs bases de données :
- Minimiser les « bias »
- Essayer de trouver le maximum d’études possible
- Aucune base de données ne contient la totalité de références sur un sujet.
Principales Bases de Données biomédicales :
- PUBMED
- EMBASE
- Cochrane Library
- Web of Science
- SciFinder
- UpToDate
- PsycINFO (Sélectionner la base dans l'interface)
Bases de données par discipline:
- Médecine fondamentale
- Médecine clinique
- Médecine dentaire
- Sciences pharmaceutiques
- Humanités(médecine) - Bioéthique
- Humanités (médecine) - Histoire et sciences humaines en médecine
UNIGE Bibliothèque. Répertoire des bases de données et ouvrages de référence
Autres bases bases de données et moteurs de recherche (liste non-exhaustive) :
- Google Scholar (multidisciplinaire)
- Zetoc (multidisciplinaire)
- LILACS (référeces biomédicales – Amerique Latine)
- OECD (anciennement SourceOCDE / SourceOECD)
- Campbell Collaboration (Social Welfare)
- LISSa (biomédicale francophone)
- Health Evidence (santé publique)
- PEDro Physiotherapy Evidence Database
- Bases de données accessibles via la HEDS Haute école de santé Genève
- Bibnet.org (biomédicale, Suisse, Autriche)
- P3 Project People Publication. Base de données de recherche du FNS
- Repias : Réseau de Prévention des Infections Associées aux Soins (ancien NosoBase)
Autres ressources:
- Swisscovery
- Liste A-Z périodiques
- CISMeF - CAtalogue et Index des sites Médicaux de langue Française
- HeTOP - Consulter le MeSH et les autres terminologies de santé
- Site web UNIGE : Données de recherche
VPN pour membres HUG (accès à distance)
L’élaboration de la stratégie de recherche est une partie essentielle dans une Revue Systématique. Les différents points de cette étape sont très importants pour que le résultat de l’interrogation des bases de données fournisse des réponses à la question de recherche formulée.
Guides sur la méthodologie de Recherche:
- UNIL Université de Lausanne. Faculté de biologie et de médecine.
Recherche structurée de littérature. Guide méthodologique. Version 08/09/2020 - HES-SO Valais.Haute école de santé. Médiathèque santé Sion
Méthodologie de recherche dans les bases de données
Juin 2020Pauline Melly
Identifier les concepts principaux de la question -> trouver des termes synonymes en langage naturel et de termes contrôlés
A partir des concepts identifiés, il est possible de trouver des termes synonymes (alternatifs ) et/ou contrôlés. Des opérateurs booléens permettent ensuite de combiner ces termes et de créer une « search strategy ».
Termes alternatifs (synonyms ou related terms): Les termes synonymes ou alternatifs (variantes ) des concepts principaux identifiés dans la question constituent une partie de la terminologie utilisée dans une équation de recherche pour la requête d'information dans une base de données. Ce sont des termes similaires utilisés dans les différentes publications pour désigner ou décrire un même concept. Exemple: Adolescent-> teenager, teen, young
Ils sont très utiles pour trouver des références plus récentes (pas encore indexées) ou sujet récent (terme contrôlé inexistant).
Où chercher des termes synonymes:
- Texte ou abstract d'un article pertinent sur un sujet
- Dictionnaires biomédicaux
- Sur la page du vocabulaire contrôlés de certaines bases de données telles que PubMed (MeSH-> Entry Terms) et Embase (Emtree-> Synonymes)
Ressources:
CQUniversity Library Identifying your Keywords
University of Newcastle Library guides. Systematic Reviews: Search strategy
Termes contrôlés: Les termes contrôlés, ou vocabulaire contrôlé, dans le domaine biomédical, sont disponibles dans les Thesaurus (listes) tels que MeSH ou Emtree. Ces listes de termes organisés hiérarchiquement, sont utilisées respectivement dans les recherches dans PubMed et Embase. Le termes MeSH sont aussi utilisés dans les recherches dans d’autres bases de données comme Cochrane Library et CINAHL. Ils augmentent la précision et exhaustivité des requêtes.
Plus de détails sur MeSH (Medical Subject Headings):
MeSH - Medical Subject Headings
CQUniversity Library What is MeSH ?
Quelques outils pour trouver des Termes contrôlés :
Autres ressources:
- HeTOP - Consulter le MeSH et les autres terminologies de santé
- University of Newcastle Library guides - Identify synonyms and related terms
Combiner les termes à l’aide des opérateurs booléens ou de proximit
Les opérateurs Booléens :
Source :STUDYLIB - Opérateurs Booléens
Ressources:
- CQUniversity Library. Combining the words using boolean operators
Vidéos :
- Bibliothèques UdeM. Les bases de la recherche d’information - Combiner ses mots
- CQUniversity Library. Combining the words using boolean operators
Etablir la « search strategy »
Suite à l’identification des concepts principaux, mots clés et de les combiner, la stratégie de recherche permet d‘interroger la/les base(s) de donnée(s).
Quelques tutoriels pour cette étape:
- Diapason – Identifier mes termes de recherche. Concevoir mon plan de travail de concepts
- Building Search Strategies
- Utilisation de « Advanced Search Builder « dans PubMed »
- Doing a systematic Review. A student guide chapitre - 4 Developing my search strategy
- Checklist for reviewing Search Strategies
- Developing My Search Strategy
Article:
J McGowan et al.PRESS Peer Review of Electronic Search Strategies: 2015 Guideline Statement
Journal of Clinical Epidemiology. Volume 75, July 2016, Pages 40-46
Library guides:
University of Melbourne. Systematic Reviews for Health Sciences and Medicine
University of Melbourne. Text Mining for Search Strategy Development
Utilisation de Filtres
Un filtre de recherche ou "hedge" ou "search string" est une séquence de termes/mots clés conçue pour un concept. Le but est d'améliorer la recherche et augmenter la précision (limiter les résultats). Il existe des listes de filtres par sujet.
Filtres de recherche: quelques listes
Autres filtres à ajouter à la fin de l'équation de recherche (limiter les résultats):
Source:Recherche structurée de littérature. Guide méthodologique. Unil CHUV 2020
Sélectionner les bases de données et lancer la recherche sur les différentes bases de données
La recherche sur plusieurs bases de données est fortement recommandée dans le cas d’une revue systématique (voir rubrique Choix des bases de données).
La stratégie de recherche doit être adaptée à chaque base de données puisque les syntaxe s sont différentes.
Voir rubrique "Identification et choix des bases de données" ou sur la Liste des bases de données de l’UNIGE
Quelques outils sur la syntaxe des bases de données :
- Syntaxe bases de données. Bibliothèque universitaire de médecine - FBM|CHUV Lausanne
- Database Syntax Guide
- Astuces et syntaxe - Bases de données en sciences de la santé
- Translating Search Strategies
Recherche sur PUBMED
- PubMed User guide
- Bium - Nouveau PubMed . Nouvelles fonctionnalités et améliorations
- Bium - Recherche dans PubMed – Syntaxe et astuces
Recherche sur Embase
Formations Bibliothèque UNIGE
La littérature grise correspond à « ce qui est produit par toutes les instances du gouvernement, de l’enseignement et la recherche publique, du commerce et de l’industrie, sous un format papier ou numérique, et qui n’est pas contrôlé par l’édition commerciale » Schöpfel, J. et al. (2015). Littérature « grise » : de l’ombre à la lumière, I2D – Information, données & documents, 1(52), 84 pages.
Elle contient de rapports, thèses, comptes-rendus de congrès, documents gouvernementaux, législations, statistiques, protocoles d’études, clinical trials, conference proceedings, research reports, patents, pre print articles, Blogs, Forum, Interviews entre autres types de documents.
Cette source d’information est complémentaire aux références trouvées dans les Bases de données.
Où chercher ?
(Listes non-exhaustives)
Sources de littérature grise :
- OpenGrey : A multidisciplinary database of the grey literature produced in European countries
- CADTH Grey Matters tool for searching for grey literature
- Greylit.org
- Duke University. Systematic Reviews : The process : Grey Literature
- GreySource Index
Clinical trials:
- Clinical trials.gov
- ICTRP: WHO International Clinical Trials Registry Platform
- SNCTP (Swiss National Clinical Trials Portal)
- Autres registres (liste)
Statistiques:
- Office fédéral de la statistique (OFS)
- Office fédéral de la santé publique (OFSP)
- Observatoire suisse de la santé (Obsan)
- OMS Organisation Mondiale de la Santé
- Eurostat
- OECD.Stat
Après avoir obtenu les listes de références de résultats de votre recherche dans les bases de données, l’étape suivante est de les exporter dans un logiciel de gestion de références (EndNote/Zotero/Mendeley) ou un autre logiciel (Covidence/Rayyan) qui permet de faire l’élimination de doublons (la même référence peut être indexée dans plusieurs bases de données).
- EndNote X9 Guide d'utilisation. UNIL Université de Lausanne. Décembre 2019
- Unisa. EndNote export from databases
- Unisa. EndNote overview
- Import Filters EndNote
- Prisma ( pour la rentrée des données dans le diagramme de flux PRISMA)
Dedoublonnage
La recherche de doublons dans des résultats de recherche est nécessaire car vous pourrez trouver la même référence d’une étude (ou d’autres versions de celle-ci ) dans des bases de données différentes.
Il est donc fortement recommandé de dédoublonner les références avant la sélection des articles pour éviter que des doublons ne soient inclus comme étant des études différentes dans la revue. Pour éviter aussi la suppression des faux doublons.
Des logiciels de gestion de références tels que EndNote, Zotero ou Mendeley proposent par défaut des procédures simplifiées. Des procédures plus rigoureuses existent et permettent de dédoublonner les résultats de façon plus optimale.
Autres procédures plus précises:
- Amsterdam Efficient Deduplication (AED) method
- LSHTM. Library & Archives Service blog
- McGill Library.Deduplication in EndNote
- DEDUPLICATION IN ENDNOTE STEP-BY-STEP | VERSION 13.02.2020 Doris Kopp, Public Health & Primary Care Library, University of Bern
Article procédure "deduplication":
- De-duplication of database search results for systematic reviews in EndNote. Wichor M. Bramer et al. J Med Libr Assoc. 2016 Jul; 104(3):240–243. doi:10.3163/1536-5050.104.3.014. PMID: 27366130
Vidéos:
- EndNote deduplication Bramer Method introduction
- EndNote deduplication Bramer Method step 1 change settings
- EndNote deduplication Bramer Method step 2 normalize imported references
- EndNote deduplication Bramer Method step 3 selecting and removing duplicate references
Obtention Textes intégraux (via réseau UNIGE):
- Dans les bases de données (PubMed, Embase), depuis la page de référence du document souhaité : bouton « Obtenir »
- Swisscovery : citation linker (liens aux ressources électroniques UNIGE)
- VPN pour membres HUG (accès à distance)
- VPN pour membres UNIGE (accès à distance)
- Demander des numérisations et des documents hors UNIGE (service gratuit pour les membres de la communauté Unige – HUG)
Dans le processus d’extraction de données les informations pertinentes sont identifiées et extraites de chaque étude individuelle.
Outils d’extraction de données (pour revues systématiques) :
- Covidence
- Covidence Importing references
- Rayyan
- Distiller
- JBI - SUMARI
- RevMan (Cochrane reviews)
- EPPI-Reviewer
- SYSREV - Extraction of data
Quelques ressources pour cette étape:
- Doing a Systematic review. A student guide. Chapitre 6 Data extraction : where do I begin
- Data extration tools
- Data extraction : where do I begin
Insertion des résultats de la sélection des études dans PRISMA
PRISMA (Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyzes) a été développé pour normaliser le «reporting» des revues systématiques.
L'organigramme montrant le nombre d'études / articles restant à chaque étape dans le but de documenter le processus de sélection des études.
La "check list 27 items" est utile pour le «reporting» pour les revues systématiques avec ou sans méta-analyse (check list 27 items). Très utile également pour la communication des résultats.
Synthèse
Le mode de synthèse des données (types de comparaisons, critères de jugement, méthode statistique utilisée) doit avoir été précisé dans le protocole de la revue.
Les données des études incluses dans la revue peuvent être synthétisées de manière quantitative, semi-quantitative ou descriptive.
- Évaluation descriptive de chaque étude, souvent présentée dans un tableau
- Si résultats des études très hétérogènes: Analyse narrative (Qualitative)
- Analyse statistique (méta-analyse) : Analyse quantitative avec des présentations numériques et graphiques des données, (analyse la force et la cohérence des preuves et rechercher les raisons des incohérences). Un des types de graphiques le plus utilisé est le Forest plot.
Ressources:
- Higgins JPT, Thomas J, Chandler J, Cumpston M, Li T, Page MJ, Welch VA (editors). Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions version 6.1 (updated September 2020). Cochrane, 2020. Part 2, Chapter 10: Analysing data and undertaking meta-analyses. Chapter 13: Assessing risk of bias due to missing results in a synthesis
- Améliorer les pratiques et l'organisation des soins : méthodologie des revues systématiques. Vincent Zaugg, Virginie Savoldelli, Brigitte Sabatier, Pierre Durieux. Dans Santé Publique 2014/5 (Vol. 26), pages 655 à 667
Méta-Analyse
L' analyse statistique (quantitative) de deux ou plusieurs études distinctes, est généralement effectuée pour augmenter la puissance et la précision et pour déterminer les réponses à des questions non posées dans les études originales. Les méta-analyses devraient inclure une recherche systématique, mais toutes les revues systématiques n'incluront pas une méta-analyse.
Buts:
- Estimer l’amplitude de l’effet (bénéfique ou délétère) d’une intervention/exposition
- Augmenter la puissance statistique pour détecter un effet
- Evaluer/ expliquer l’hétérogénéité des études (raisons des incohérences)
- Evaluer l’effet d’une intervention/exposition dans un sous-groupe de la population
- Adresser les controverses issues de résultats apparemment discordants entre les études
Ressources:
- Higgins JPT, Thomas J, Chandler J, Cumpston M, Li T, Page MJ, Welch VA (editors). Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions version 6.2 (updated February 2021). Cochrane, 2021. Available from www.training.cochrane.org/handbook. Chapter 10: Analysing data and undertaking meta-analyses
- Tawfik, G.M., Dila, K.A.S., Mohamed, M.Y.F. et al. A step by step guide for conducting a systematic review and meta-analysis with simulation data. Trop Med Health 47, 46 (2019). https://doi.org/10.1186/s41182-019-0165-6
Le Centre de Recherche Clinique (CRC) aux HUG propose un service d’aide aux chercheurs dans la réalisation des projets de recherche clinique (p ex.choix des méthodes d’analyse et de modélisation statistique, analyse des données, préparation de tableaux de résultats, interprétation des résultats):
Service d’Epidémiologie clinique CRC HUG. Appui méthodologique
Bibliothèque UNIGE CMU « Rédiger, Publier »
Autres ressources:
- Doing a Systematic Review: A Student's Guide. « Writing My Discussion and Conclusions »
- Systematic reviews: Write your review
- PRISMA statement (Preferred Reporting Items for Systematic reviews and Meta-Analyses) : check list
- EQUATOR General guidance on scientific writing
- Cochrane guide MECIR(Methodological Expectations of Cochrane Intervention reviews)
- McGill. Guidelines on what to include in your manuscript
- UOttawa. Bibliothèque. Rédiger la revue pour publication
- INESS Normes de production de Revues systématiques
Définition de Revue Systématique
- Cochrane Suisse
- Campbell collaboration
- University of Toronto - Libraries
- Cochrane Training
- Pippa Hemingway PhD BSc (Hons) RGN RSCN Research Fellowin Systematic Reviewing, School of Health and Related Research (ScHARR),University of Sheffield Nic Brereton PhD BSc(Hons)Health Economist, NBConsulting Services, Sheffiel. April 2009. What is as ystematicreview ?
Formulation de la question
- Schardt C, Adams MB, Owens T, Keitz S, Fontelo P. Utilization of the PICO framework to improve searching PubMed for clinical questions. BMC Med Inform Decis Mak. 2007;7:16. Published 2007 Jun 15
- CEBM - Asking Focused Questions
Réalisation Revue Systématique
Guidelines /outils :
- Muka T, Glisic M, Milic J, Verhoog S, Bohlius J, Bramer W, Chowdhury R, Franco OH. A 24-step guide on how to design, conduct, and successfully publish a systematic review and meta-analysis in medical research. Eur J Epidemiol. 2020 Jan;35(1):49-60. doi: 10.1007/s10654-019-00576-5. PMID: 31720912
- Centre for reviews and dissemination. Systematic Reviews CRD’s Guidance for Undertaking Reviews in Health Care. York, UK: University of York, Centre for Reviews and Dissemination, 2009
- Agency for Healthcare Research and Quality (AHRQ). Practical Tools and Guidance for Systematic Review of Complex Interventions
- Siddaway AP, Wood AM, Hedges LV. How to Do a Systematic Review: A Best Practice Guide for Conducting and Reporting Narrative Reviews, Meta-Analyses, and Meta-Syntheses. Annu Rev Psychol. 2019;70:747-770. doi:10.1146/annurev-psych-010418-102803
- EQUATOR (Enhancing the QUAlity and Transparency Of health Research) Network
- PRISMA Elaboration and Explanation
- Marshall, C., Sutton, A., O'Keefe, H., Johnson, E. (Eds.). (2022). The Systematic Review Toolbox. Available from: http://www.systematicreviewtools.com/
- KTDRR, American Institutes for research. Resources for Conducting Systematic Reviews
- Temple University Libraries.Research Guides, Health Science Libraries. Systematic Review Tools
- Tianjing Li. Johns Hopkins University. Coursera. Introduction to Systematic Review and Meta-Analysis .
Articles :
- Tawfik, G.M., Dila, K.A.S., Mohamed, M.Y.F. et al. A step by step guide for conducting a systematic review and meta-analysis with simulation data. Trop Med Health 47, 46 (2019). https://doi.org/10.1186/s41182-019-0165-6
- Joshua D. Harris. How to Write a Systematic Review. First Published August 7, 2013. https://doi.org/10.1177/0363546513497567.PMID: 23925575
- Khalid S Khan et al. Five steps to conducting a systematic review. J R Soc Med. 2003 Mar; 96(3): 118–121. doi: 10.1258/jrsm.96.3.118 PMID: 12612111/
Normes :
- Institut national d’excellence en santé et en services sociaux (INESSS). Les normes de production des revues systématiques.Guide méthodologique. Document rédigé par Valérie Martin et Jolianne Renaud sous la direction de Pierre Dagenais. Montréal, Qc: INESSS; 2013. 44p
OUVRAGES (papier et/ou en ligne) :
- Higgins JPT, Thomas J, Chandler J, Cumpston M, Li T, Page MJ, Welch VA (editors). Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions version 6.0 (updated July 2019). Cochrane, 2019. Available from www.training.cochrane.org/handbook.
- S. Patole. Principles and Practice of Systematic Reviews and Meta-Analysis. 2021. Springer, Switzerland. Accès en ligne.
- Fink, Arlene. Conducting research literature reviews : from the internet to paper. 5th ed. Los Angeles : SAGE. 2020
- Higgins JPT, Thomas J, Chandler J, Cumpston M, Li T, Page MJ, Welch VA (editors). Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions, version 6.3 (updated February 2022). Cochrane, 2022.
Available from www.training.cochrane.org/handbook. - Margaret J. Jewell, Sarah T. Foster, Margaret J. Foster, Margaret J. Foster. Assembling the Pieces of a Systematic Review. Rowman & Littlefield Publishers. 2017
- Boland, Angela. Doing a systematic review : a student's guide. Los Angeles : SAGE Publications. 2017
- Gough, David, Oliver, Sandy, Thomas, James, médecin. An introduction to systematic reviews. . Los Angeles : SAGE. 2017
- Comprehensive Systematic Review for advanced Practice Nusring. SpringerPublishing Company. 2016
- Finding What Works in Health Care: Standards for Systematic Reviews. Research, Committee on Standards for Systematic Reviews of Comparative Effectiveness, Ebook Central Perpetual and DDA titles (ProQuest)
- Khan, Khalid Saaed, ed. Systematic Reviews to Support Evidence-Based Medicine: How to Review and Apply Findings of Healthcare Research. 2nd ed. London: Hodder Arnold, 2011
Formations en ligne :
- Cochrane Interactive Learning: Conducting an Intervention Review. Module 1-4
- Johns-Hopkins University. Coursera.Introduction to Systematic Review and Meta-Analysis.
Lib Guides :
- Harvey Cushing / John Hay Whitney Medical Library
- University of Toronto - Librairies
- Ottawa - Bibliothèque
- UMD Libraries. Research Guides : Steps of a Systematic Review
Revues systématiques d'études pré-cliniques et dans d’autres domaines:
- Cochrane training - Systematic reviews of preclinical animal research: who are the potential knowledge users?
- BIH Berlin Institute of Health - Preclinical Systematic Review and Meta-Analysis
- Collaboration for Environmental Evidence (CEE)·2013.
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