Serge Bouillaguet accomplit sa formation en médecine dentaire à l’Université d’Aix-Marseille ou il obtient un doctorat en 1984. Il se forme ensuite la Faculté de médecine de l’UNIGE, où il obtient un diplôme de médecin-dentiste en 1987, un doctorat en médecine dentaire (1989), un certificat de spécialisation en biomatériaux (1998), un certificat de spécialisation en cariologie (2002). En 2003, il est nommé privat-docent et prend la direction de l’Unité d’endodontie. Nommé professeur associé en 2011, puis promu professeur ordinaire en avril 2019, il occupe actuellement les fonctions de directeur du département de médecine dentaire préventive et de premier recours et de conseiller académique à la Clinique universitaire de médecine dentaire. Serge Bouillaguet a pour domaines de recherche le microbiote buccal, la bactériologie associée aux infections endodontiques, le développement d’agents pharmacologiques destinés au traitement de ces pathologies. Son activité clinique est exclusivement dédiée aux traitements endodontiques.