Guy Haller obtient un diplôme de médecin à Genève en 1993. Après un Doctorat en médecine en 1997 et une spécialisation en anesthésiologie à Genève, il complète sa formation post-graduée à l’étranger où il obtient un Master en informatique médicale (Université de Bath, UK) et un PhD en épidémiologie (Université de Monash-Melbourne, Australie).

De retour à Genève en 2006, il devient médecin adjoint au Département hospitalier de médecine aiguë (unité d’anesthésie gynéco-obstétricale et ophtalmologique), poste qu’il partage à 50% avec une activité dirigée vers la qualité des soins et l’épidémiologie au service qualité des soins et au service d’épidémiologie clinique. Il prend en 2015, la direction du projet stratégique 20/20 « Excellence clinique et qualité » des HUG. Il enseigne en parallèle la gestion des services de santé et la qualité à l’Université de Monash comme professeur associé. Il dirige plusieurs travaux et un groupe de recherche autour des facteurs de risque organisationnels des complications iatrogéniques et des problématiques de mesure et d’amélioration de la qualité des soins. Privat-docent de la Faculté de médecine de l’UNIGE et chargé de cours en 2017, il est nommé professeur assistant au Département d’anesthésiologie, pharmacologie, soins intensifs et urgences en août 2021.