Benedikt Huttner effectue des études de médecine à Munich et à Nice. Arrivé en Suisse en 2002, il suit sa formation à Bellinzone, Zurich et Genève et obtient un titre de spécialiste en maladies infectieuses en 2010. Depuis 2007, il travaille aux HUG dans les services de prévention et contrôle de l’infection et des maladies infectieuses. De 2010 à 2012, il effectue un séjour de recherche à Salt Lake City, USA, où il obtient un master en sciences d'investigation clinique. En 2017, il accède à la fonction de médecin
adjoint agrégé au Services des maladies infectieuses des HUG. En parallèle de son activité clinique, Benedikt Huttner conduit et participe à de nombreuses études nationales et internationales dans le domaine de la bonne utilisation des antibiotiques et du contrôle des bactéries multi-résistantes. Depuis 2017, il travaille, en parallèle à son activité clinique, comme consultant auprès de l’Organisation mondiale de la Santé. Depuis 2018, il est aussi membre du guidelines subcommittee de la Société européenne de microbiologie et maladies infectieuses. Il est nommé professeur assistant au Département de médecine de la Faculté de médecine en février 2020.