Eduardo Schiffer obtient un diplôme de médecin en 1990 et s’engage ensuite dans une formation post-graduée en anesthésiologie. Affilié au laboratoire d’investigations anesthésiologiques des HUG, il axe ses recherches sur les modifications hémodynamiques du choc septique. Il poursuit ensuite sa formation de clinicien en médecine interne (titre de spécialiste en 1996) puis revient à l’anesthésiologie pour obtenir en 1999 un titre de spécialiste. Après un séjour à l’Université des sciences de l'homme et de la santé Paris Descartes, il poursuit ses recherches sur les maladies pulmonaires liées à l’insuffisance hépatique terminale. Médecin adjoint agrégé dès 2010, responsable de l’Unité d’anesthésiologie ambulatoire, digestive, urologique et orthopédique, son activité clinique se focalise sur la chirurgie abdominale majeure et notamment sur la transplantation hépatique et rénale. Depuis 2014, Eduardo Schiffer est responsable du Programme d’enseignement des compétences cliniques des cursus Bachelor et Master de la Faculté de médecine. Nommé professeur assistant au Département d’anesthésiologie, pharmacologie et soins intensifs de la Faculté de médecine en 2017, il est titularisé à la fonction de professeur associé au Département d’anesthésiologie, pharmacologie et soins intensifs et urgences en octobre 2019.