Simone Becattini obtient en 2008 un master en biologie médicale de l’Université de Florence. Après des stages de recherche à l’Institut national de la santé à Rome et à l’Institut Karolinska de Stockholm, il rejoint l’Institut de recherche en biomédecine de Bellinzone et l’EPFZ. Il y obtient en 2015 un PhD en immunologie et microbiologie. Ses recherches concernent alors l’hétérogénéité fonctionnelle des lymphocytes T humains générés en réponse aux agents infectieux et aux vaccins.

Il effectue ensuite un séjour post-doctoral au Memorial Sloan Kettering Cancer Center à New York, où il travaille sur divers aspects de la biologie du microbiote intestinal. En octobre 2019, lauréat d’un subside Eccellenza du FNS, il est nommé professeur assistant et rejoint le Département de pathologie et immunologie de la Faculté de médecine de l’UNIGE. Le laboratoire qu’il y met sur pied a pour objectif la compréhension des interactions entre le microbiote intestinal et le système immunitaire de l’hôte, et l’exploitation de ces connaissances pour lutter contre les maladies infectieuses et inflammatoires.