Zoltan Pataky termine ses études de médecine en 1995, puis obtient un doctorat en médecine à l’Université de Genève en 2000, pour lequel il obtient le prix Denber-Pinard. Il obtient également un titre de spécialiste en médecine interne en 2011. Aux HUG, il est actuellement médecin adjoint agrégé dans le Service d’endocrinologie diabétologie, nutrition et éducation thérapeutique du patient, responsable de l’unité d’éducation thérapeutique du patient, responsable de la consultation de l’obésité, et co-directeur de Centre de l’obésité. Il dirige en outre le Centre collaborateur OMS pour la référence et la recherche dans le domaine de l'éducation et des stratégies de suivi à long terme des maladies chroniques, hébergé aux HUG, et vice-président de l’Association suisse pour l’étude du métabolisme et de l’obésité (ASEMO).

Sur le plan de la recherche, Zoltan Pataky s’intéresse particulièrement à l’obésité, à l’éducation thérapeutique des personnes diabétiques et obèses et à la prévention de l’amputation chez les diabétiques. Privat-docent de la Faculté de médecine en 2012, chargé de cours en 2015 et professeur assistant en 2019, il est nommé professeur associé au Département de médecine en avril 2023.