Amos Bairoch effectue des études de biochimie à Genève et obtient un doctorat en 1989. Il travaille alors sur Swiss-Prot et PROSITE, deux bases de données de référence sur les protéines, de même que sur PC/Gene, un logiciel d’analyse de séquences de protéines et d’acides nucléiques utilisé pendant plus de 20 ans par des milliers de laboratoires dans le monde. Dès 1993, Swiss-Prot est mis à disposition sur www.expasy.org, le premier site web consacré à la recherche en sciences de la vie. En 2000, Swiss-Prot devient une collaboration internationale, le consortium UniProt, avec l’EBI (Royaume-Uni) et PIR (USA). Depuis sa création en 1986, Swiss-Prot a été utilisé par des centaines de milliers de personnes.

En 2009, Amos Bairoch crée le groupe CALIPHO qui combine des approches expérimentales avec le développement de la base de données neXtProt afin de permettre l’étude des protéines humaines connues et inconnues. Il lance également la base de données centrée sur les lignées cellulaires Cellosaurus. Il est également à l’origine du SIB – Institut Suisse de Bioinformatique, créé en 1998 avec quatre collègues, dont il est toujours membre du Conseil de fondation. Le SIB fédère les activités de recherche et de support en bioinformatique en Suisse et compte actuellement 87 groupes appartenant à 26 institutions académiques.

Amos Bairoch est aussi le lauréat de nombreuses dinstinctions, dont le prix Pehr Edman et le Prix Européen Latsis en 2004, le prix Otto Naegli en 2010, le «HUPO Distinguished Achievement Award in Proteomic Sciences» en 2011 et le «ABRF award for Outstanding Contributions to Biomolecular Technologies» en 2018. Par ailleurs très investi dans l’enseignement et dans la vie facultaire, il a été de 2017 à 2022 vice-président de la Section de médecine fondamentale de la Faculté de médecine et a dirigé pendant 12 ans le Département de science des protéines humaines. Professeur ordinaire depuis 2010, il est nommé professeur honoraire en octobre 2023.