Groupe d'intérêt RDF/Linked Data
Le groupe d'intérêt RDF (Resource Description Framework) Linked Data (Web des données), actif depuis 2018, est composé d'un groupe de travail transversal au sein de l'UNIGE. Il organise des rencontres mensuelles sur différents thèmes liés au RDF/Linked Data, coordonnées par des membres de la DiSTIC.
Vous trouverez ci-dessous les dernières rencontres du groupe
avec leur présentateur/trice, titre et descriptif.
20 septembre 2024
Présentateurs : Kerfalla Cisse et Antonio Dantas
"GraphRAG avec neo4j et ontotext graphdb"
GraphRAG est une extension du modèle RAG (Retrieval-Augmented Generation). Tandis que RAG combine des modèles de récupération d'informations et de génération de texte pour produire des réponses basées sur des documents pertinents, GraphRAG intègre des données structurées sous forme de graphes (comme les bases de connaissances RDF). Cela permet de générer des réponses plus précises et contextuelles en exploitant non seulement les textes récupérés, mais aussi les relations explicites entre les données dans un graphe, améliorant ainsi la précision et la pertinence des réponses.
6 février 2024
Présentateur : Kerfalla Cisse
Sujet : Présentation d'un travail de bachelor portant sur la réalisation d'un agent conversationnel intelligent exploitant un graphe de connaissances sur les restaurants suisses et permettant de l'interroger, de le compléter, de l'adapter, de lui appliquer des requêtes fédérées avec des référentiels standard et par conséquent, d’élargir ses connaissances à travers les questions posées et d’affiner les conversations avec les utilisateurs. Il exploite les données en provenance de Geonames, Dbpedia et OpenStreetMap.
5 décembre 2023
Présentateur : Nicola Carboni
Thème : La modélisation et l'analyse des expositions d'art historique, sujet d’un travail en cours.
7 novembre 2023
Présentateur : Gilles Falquet
Sujet : Présentations et échanges sur RDF 1.2 (anciennement RDF-star)
4 avril 2023
Présentateurs : Arnaud Gaudinat et Christophe Lebrun, HES-SO - HEG Genève
Titre : Présentation du projet FairChain, une base de connaissance interopérable sur le domaine de la blockchain basée sur le moteur Wikibase de Wikidata
La blockchain est une technologie relativement complexe, multiple et en développement continue que certains qualifient de révolutionnaire ou disruptive pour la société. Naturellement transparente en tant que chaîne publique, elle est dans les faits difficilement accessible. Les ressources la décrivant sont disparates, peu à jour, et il n’existe pas d’uniformisation. Ce projet propose d’offrir une base de connaissance qui permettra d’uniformiser et de comparer les différentes chaînes pour mieux les comprendre.
Nous avons déployé une solution basée sur Wikibase, le moteur de Wikidata et avons commencé à développer quelques cas d'usages. À terme le projet a aussi pour ambition de combiner cette base de connaissance avec de l’information on-chain, dynamique par nature. Nous donnerons un aperçu de la problématique et de la solution développée, agrémenté des quelques premières démonstrations en avant-première et discuterons des perspectives.
7 février 2023
Présentatrice : Dr. Catherine Hayes
Dr. Catherine Hayes works in the Proteome Informatics Group (PIG) of SIB, under the direction of Dr. Frederique Lisacek, as a senior biocurator and bioinformatician. Her main tasks are biocuration of glycoprotein data into the GlyConnect resource, and development and maintenance of their GlySTreeM resource (triple store of glycan molecules).
Titre : Glycan-protein interaction motifs: A semantic based annotation method
Abstract/Motivation: We have previously designed and implemented a tree-based ontology to represent glycan structures with the aim of searching these structures with a glyco-driven syntax. This resulted in creating the GlySTreeM knowledge-base as a linchpin of the structural matching procedure and we now introduce a query language, called GlycoQL, for the actual implementation of a glycan structure search.
Results: The methodology is described and illustrated with a use-case focused on Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) spike protein glycosylation. We show how to enhance site annotation with federated queries involving UniProt and GlyConnect, our glycoprotein database.
> Availability and implementation.